原因是在html中加上文档类型(DOCTYPE)后判断屏幕坐标出错,网络上也有解决方法，就是去掉文档类型，这种治标不治本的方法我觉得很不合理，本人花了点时间修改了一下。经测试ie6、ie7、firefox2.0、firefox3.0 是没有任何问题的,其他的我没有测试。改后的压缩文件多了2KB左右,现在为16.2 KB。在目前的网络带宽下还是比较合理的。如果有需要我可以提供popup.js注释版。请相信博主是有分享精神的。
历史版本说明：
V1.0.0　 2008.07
从百度空间下载popup.js，并运用到博客系统中
V1.1.0　 2008.07　
修改由于与文档类型(DOCTYPE)冲突，遮罩层错位
V1.2.0　 2008.11　
修改由于页面较短，遮罩层不能完全遮罩页面
修改在非全屏下打开遮罩，再全屏页面后遮罩层不能全屏问题
修改对话框可拖出遮罩区域问题

20100413更新了下，一点小问题。
在线测试 http://img.jb51.net/online/popup/popup.html

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