一个转换程序，简单的把DNA序列中的A转变成T，第一种情况没有使用私有变量。
复制代码 代码如下:
#!/bin/perl
#下面是一段DNA序列
$DNA=ATTATATAT;#这里是我们的序列
$result=A_to_T($DNA);
print "I changed all $DNA A to T, and the we get the result $result\n\n";

sub A_to_T
{
my ($input)=@_;
$DNA=$input;#没有使用私有变量
$DNA=~s/A/T/g;
return $DNA;
}

结果如下：
F:\>perl\a.pl
I changed all TTTTTTTTT A to T, and the we get the result TTTTTTTTT

F:\>
这里我们发现$DNA的值变成了TTTTTTTTT，而不是以前ATTATATAT。这是因为在子程序中，我们使用了同样的$DNA 变量，而在子程序中它的值已经被改变了。所以输出的时候就是改变以后的值。

下面把子程序中的 $DNA 进行私有变量声明：

复制代码 代码如下:
#!/bin/perl
#下面是一段DNA序列
$DNA=ATTATATAT;
$result=A_to_T($DNA);
print "I changed all $DNA A to T, and the we get the result $result\n\n";

sub A_to_T
{
my ($input)=@_;
my $DNA=$input;
$DNA=~s/A/T/g;
return $DNA;
}

结果如下：
F:\>perl\a.pl
I changed all ATTATATAT A to T, and the we get the result TTTTTTTTT

F:\>

这样就正常了。

当然你可以说，在子程序中可以完全不用$DNA这一个变量，就如同下面一样：

复制代码 代码如下:
#!/bin/perl
#下面是一段DNA序列
$DNA=ATTATATAT;
$result=A_to_T($DNA);
print "I changed all $DNA A to T, and the we get the result $result\n\n";

sub A_to_T
{
my ($input)=@_;
$dna_to_change=$input;
$dna_to_change=~s/A/T/g;
return $dan_to_change;
}

得到的也是正常的结果：
F:\>perl\a.pl
I changed all ATTATATAT A to T, and the we get the result

F:\>

但是，没有人能够保证你不会一时糊涂，在子程序用了程序中的变量。或者当你第一次使用的时候，可以避免，当你过来几个月以后回过头再来使用的时候，就不能保证完全正确了，所以为了代码的通用性，还是在所有的子程序中使用my私有变量吧。