1、非法转让问题

　　所谓非法转让注册商标就是指注册商标的转让人并不是该注册商标的所有人，或者是不能代表全部商标所有人，或者是未经注册商标权利所有人同意，而以隐瞒、欺诈、伪造等不正当手段将其注册商标偷偷转让的。在现有的商标转让程序中由于客观存在的漏洞，要做出这样的事来并非困难，虽然事后完全可以通过法律途径解决和保护商标权利人的利益，但当事人遭受的重大损失将是无法弥补的。

　　2、无效转让问题

　　所谓无效转让就是指注册商标的转让不符合律所规定的限制条件，虽然商标转让双方已签订了商标转让协议，并且乙方也已支付了商标转让费，但该注册商标转让申请根本不可能被国家商标局核准，因此，该商标的转让是无效的，因为商标无法被核准转让，所以商标的所有人仍然没有变。

　　由于国家商标局办理注册商标转让审核的周期少则半年，多则一年以上的时间，再加上转让双方签订商标转让协议后，需要支付转让款项，准备相关的商标转让申请文件资料，邮寄打印等等。因此，商标转让协议签订后，受让方并无法立即确定该被转让商标是否能被国家商标局核准转让注册，而起码需要有六个月以上的时间才能。

　　3、部分转让问题

　　所谓部分转让就是指注册商标的转让人，未将与被转让商标权利相关的其他同类近似商标一并转让给商标受让人，而是有意或无意的保留或隐瞒了一部分与转让商标相近似的同类商标，转让人在商标转让之后仍可以使用与被转让商标相近似的其他商标，对商标受让人造成了实质性的伤害。

　　4、隐瞒被转让商标的权益漏洞问题

　　商标转让人在转让该商标时，隐瞒了该商标在转让之前已经被许可他人使用、被质押抵债、被转让等等问题，使得商标受让人在受让商标后的权益。