1、受到商务主管部门的行政处罚

　　备案是《条例》所规定的管理性的强制规范，《条例》明确规定，特许人未按条例规定向商务主管部门备案的，由商务主管部门责令限期备案，逾期仍不备案的，处5万元以上10万元以下的罚款，并予以公告。

　　2、对特许经营活动产生不利影响

　　尽管备案从性质上说，是一个事后的告知性行为，但是根据《条例》的规定，这种告知包含了部分对于特许人资格确认的内容，同时由于备案实行网上公告制度，即根据《条例》规定，只要通过备案的企业都会通过政府网站予以公告，通过备案对被特许人的加盟决策起到一定的积极引导作用。与此相对，如果已经从事特许经营的特许人没有备案，投资人将会对特许人的招商资格和特许经营能力产生质疑。

　　3、会增加经营风险，降低诚信度

　　随着政府部门信息共享机制的建立和逐步完善，不履行备案义务的企业将受相关行政管理部门、行政执法机关以及司法机关的关注，特别是因不备案遭受行政处罚后，可能影响到企业开设分公司的批准或影响年检注册，同时会增加败诉的可能性。