它们之间有区别吗？

开发过程中似乎很少有人去加个额外的window，觉得多此一举。比如Ajax过程中回调函数解析JSON格式字符串
复制代码 代码如下:
...
function callback(str){
var json = eval('(' + str + ')');
}
...

通常直接使用eval，而非var json = window.eval('(' + str + ')');
又比如调试时使用alert，很少有人使用window.alert；IE中获取事件对象使用event，很少有人使用window.event。（Firefox中在某些情况下也支持event而不支持window.event。感兴趣的同学看看这篇 获取事件对象的全家）

但由于各个引擎实现差异，它们的区别还是有的。
复制代码 代码如下:
var x = 5;
function fn(){
var x = 'jack';
eval('x=10;');
}
fn();
alert(x); // -->5

所有浏览器中输出的都是5，说明调用fn后eval修改的是fn内的局部变量x，而非全局的x。即eval执行的闭包环境是在fn内。

修改下，把以上代码的eval换成window.eval，测试后发现各个浏览器中的表现不一样了。

IE6/7/8 : 仍然输出5，即没有修改全局变量x，修改的仍然是局部变量x。
IE9/Firefox/Safari/Chrome/Opera : 输出10，修改的是全局变量x。

可以得出结论了
IE6/7/8中，eval和window.eval一样，写在自定义函数内是局部闭包，否则是全局闭包。
IE9/Firefox/Safari/Chrome/Opera中，eval同以上IE6/7/8，window.eval即使写在自定义函数内使用的也是全局闭包。

此外：IE中的window.execScript总是在全局闭包下执行，令人惊奇的是Chrome也支持该方法。呵，Chrome策略是标准，IE一个不能少。