时间:2021-05-22
之前介绍过单个nii文件转换成png图像:
这里介绍将多个nii文件(保存在一个文件夹下)转换成png图像。且图像单个文件夹的名称与nii名字相同。
import numpy as npimport os #遍历文件夹import nibabel as nib #nii格式一般都会用到这个包import imageio #转换成图像 def nii_to_image(niifile): filenames = os.listdir(filepath) #读取nii文件夹 slice_trans = [] for f in filenames: #开始读取nii文件 img_path = os.path.join(filepath, f) img = nib.load(img_path) #读取nii img_fdata = img.get_fdata() fname = f.replace('.nii','') #去掉nii的后缀名 img_f_path = os.path.join(imgfile, fname) #创建nii对应的图像的文件夹 if not os.path.exists(img_f_path): os.mkdir(img_f_path) #新建文件夹 #开始转换为图像 (x,y,z) = img.shape for i in range(z): #z是图像的序列 silce = img_fdata[i, :, :] #选择哪个方向的切片都可以 imageio.imwrite(os.path.join(img_f_path,'{}.png'.format(i)), silce) #保存图像 if __name__ == '__main__': filepath = 'nii的文件夹' imgfile = 'image的文件夹' nii_to_image(filepath)代码是我自己写的,用于处理ADNI的nii格式完全有效。
以上就是本文的全部内容,希望对大家的学习有所帮助,也希望大家多多支持。
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这里介绍一个nii文件保存为png格式的方法。这篇文章是介绍多个nii文件保存为png格式的方法:系统:Ubuntu16.04软件:python3.5先用pip
有时在处理文件时候,我们需要将中文姓名转换为拼音,或者是转换为拼音首字母,本文将介绍三种Python实现的方法,最后给一个批量操作的代码案例!一、xpinyin
本文实例讲述了Python实现批量转换文件编码的方法。分享给大家供大家参考。具体如下:这里将某个目录下的所有文件从一种编码转换为另一种编码,然后保存import
读取nii或者nii.gz文件中的信息,并且输出图像。importmatplotlibfrommatplotlibimportpylabaspltimportn
问题:我正尝试使用matplotlib读取RGB图像并将其转换为灰度。在matlab中,我使用这个:img=rgb2gray(imread('image.png